焦碳酸二乙酯是RNA酶的化学修饰剂,它和RNA酶的活性基团组氨酸的咪唑环反应而抑制酶活性。DEPC与氨水溶液混合会产生致癌物,因而使用时需小心。DEPC能与胺和巯基反应,因而含Tris和DTT的试剂不能用DEPC处理。 闻起来香香甜甜的,可是害人不眨眼!,怀疑是致癌剂.开瓶时将瓶子远离你,内压可导致溅泼.操作时戴合适的手套,穿工作服,并在化学通风橱里进行.
焦碳酸二乙酯已用作饮料类食品的抗菌剂，如果汁、酒和啤酒。它的优点是可用于水溶液的冷巴氏消毒法（Cold Pasteurigalion Process），并易水解成乙醇和二氧化碳。在酸性饮料中（低于pH 4.0）其用量范围为120～300mg/kg,在此条件下大约60min内可杀灭全部酵母菌。其他有耐受力的微生物如象乳酸菌,只有当微生物数量很少(﹤500个/ml)和pH低于4.0时，才能达到消毒的目的。低pH的好处是能降低焦碳酸二乙酯的分解速率和增强它的杀菌效力。
浓焦碳酸二乙酯有刺激性。可是，在酸性饮料中 24h 内基本上完全水解，几乎直接毒性。遗憾的是，焦碳酸二乙酯与一些化合物反应有可能生成乙酯基衍生物和乙酯。尿烷是一种已知的致癌物质。虽然尚未见到食品经焦碳酸二乙酯处理后生成尿烷的报道，但有人采用灵敏的同位素稀释示踪技术已发现曾用焦碳酸二乙酯处理过的橙汁、啤酒和葡萄酒含有0.17～2.6mg/kg的尿烷。由于氨普遍存在于动、植物组织中，因此用焦碳酸二乙酯处理过的食品有可能含有极少量尿烷。基于这一点，有的国家已明令禁止在食品中使用焦碳酸二乙酯。